毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话之后路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了蓝色的少年与蓝色的斑马从天而降的雨……根据犯人寄来的挑战书若不能解读谜之暗号便无法阻止接下来的爆炸小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走却完全找不到破解暗号的方法另一方面此时的江户川柯南与灰原和少年侦探团一起沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中正当比赛渐入佳境之时从兰打来的电话那里柯南得知了威胁电话的事情柯南为了解读暗号独自一人离开赛场却得知了无人能够阻止的恐怖事实……