故事以架空设定的农学院为舞台，讲述一个东京农业大学的学生小文在学园里的日常生活。但是他拥有可以看见常人看不见的“菌”的特异体质，这种能力在小文所从事的领域简直可以称为“宝具”，引起骚动也在情理之中。