一颗陨石坠落到地球的海洋中造成海水蒸发大片海洋消失地球的气候因此出现异常人类的生存环境不断恶化地球上的树木枯萎土地都变成了沙漠更可怕的是从那颗陨石中冒出了大量的外星生物异虫它们有着强大的力量并开始侵略人类的世界让人类处在恐慌之中为了对抗外敌的入侵人类组成杰特这个特殊武力组织并且花费人力物力开发出了假面骑士系统然而一些杰特的成员因不满杰特的做法而选择脱离组织成立了一个新的组织新杰特杰特和新杰特冲突不断在一次杰特与新杰特的对抗中一个神秘的男子天道总司出现了他拥有变身成为假面骑士甲斗王的强大能力但却不属于任何一个组织这让交战双方都感到非常惊讶其实在这场纷争背后有一个可怕的阴谋正在悄悄地进行……